Toda la lista que tienes es muy interesante. Practicamente a todos esos sitios puedes hacer una excursión de un día.
No te pierdas la Certosa de Pavia. A pesar de su nombre no está en la ciudad. Para ir en tren tiene una pequeña estación, casi apeadero; comprueba los horarios, que no son muchos, especialmente en fin de semana. También tienes autobús directo desde Famagosta, una de las últimas paradas del metro de Milán hacia el sur.
También para excursión corta, incluso de medio día, está Monza. Muy cerca, con un duomo majo y un gran parque donde está el circuito de carreras. No da para más de un día, pero está tan cerca de Milán, que casi puedes considerarlo una visita de un barrio de la ciudad. Son menos de 20 minutos.
Si buscas "regione lombardia orari trasporti" la primera página que aparece es un buscador de horarios en transporte público de la región. No se como llegué hasta esta página, y el nombre es una sucesión de números sin sentido, al menos para mí. Es una página muy básica y de diseño casi feo, pero funciona bien; puede parecer lenta, pero va bien.